توصلت الولايات المتحدة إلى صفقة إقرار بالذنب مع خالد شيخ محمد، المزعوم أنه العقل المدبر لهجمات 11 ايلول/ سبتمبر، واثنين من المتهمين الآخرين، وفقاً لوزارة الدفاع الأمريكية.
خالد شيخ محمد، المعروف اختصاراً بـ KSM، تم القبض عليه في باكستان عام 2003 بتهمة التورط في الهجمات الإرهابية. في عام 2008، وُجهت إليه قائمة من التهم تشمل المؤامرة، والقتل بانتهاك قوانين الحرب، والهجوم على المدنيين، والهجوم على الممتلكات المدنية، والتسبب عمداً في إصابات جسدية خطيرة، وتدمير الممتلكات بانتهاك قوانين الحرب، والإرهاب وتقديم الدعم للإرهاب. وقد أعلنت الولايات المتحدة أنها ستسعى إلى تنفيذ حكم الإعدام بحق محمد.
كما تم التوصل إلى اتفاقات إقرار بالذنب مع وليد محمد صالح مبارك بن عطاش ومصطفى أحمد آدم الهوساوي، وفقاً للبنتاغون.
